Изследователите идентифицираха над 5500 нови вируса в океана, включително липсваща връзка в еволюцията на вирусите

Публикувано: 7 април 2022 г., 19:01 ч. BST

https://theconversation.com/researchers-identified-over-5-500-new-viruses-in-the-ocean-including-a-missing-link-in-viral-evolution-180545



Изследователската кратка е кратка справка за интересна академична работа.

 

Голямата идея   Диаграма на биологичната класификационна система, показваща типът е широко групиране. VectorMine/iStock чрез Getty Images Plus Анализ на генетичния материал в океана идентифицира хиляди неизвестни досега РНК вируси и удвои броя на фила или биологични групи на вируси, за които се смята, че съществуват, според ново проучване, което нашият  екип  от  изследователи публикува в списанието Science .

 

РНК вирусите са най-известни с болестите , които причиняват при хората, вариращи от обикновена настинка до COVID-19. Те също така заразяват растения и животни, важни за хората.

 

Тези вируси носят своята генетична информация в РНК, а не в ДНК. РНК вирусите се развиват с много по-бързи темпове от ДНК вирусите. Докато учените са каталогизирали стотици хиляди ДНК вируси в техните естествени екосистеми, РНК вирусите са относително непроучени.

 

    В океаните има повече РНК вируси, отколкото изследователите смятаха преди. Гийермо Домингес Уерта , CC BY-ND За разлика от хората и други организми, съставени от клетки, обаче, вирусите нямат уникални къси участъци от ДНК, които биха могли да действат като това, което изследователите наричат ​​генетичен баркод . Без този баркод опитът за разграничаване на различни видове вируси в дивата природа може да бъде предизвикателство.

 

За да заобиколим това ограничение, решихме да идентифицираме гена, който кодира конкретен протеин , който позволява на вируса да репликира своя генетичен материал. Това е единственият протеин, който всички РНК вируси споделят, защото играе съществена роля в начина, по който се размножават. Всеки РНК вирус обаче има малки разлики в гена, който кодира протеина, който може да помогне за разграничаването на един тип вирус от друг.

 

Затова прегледахме глобална база данни от РНК последователности от планктон, събрани по време на четиригодишния глобален изследователски проект за експедиции на Океаните на Тара . Планктонът са всякакви водни организми, които са твърде малки, за да плуват срещу течението. Те са жизненоважна част от океанските хранителни мрежи и са често срещани гостоприемници за РНК вируси. Нашият скрининг в крайна сметка идентифицира над 44 000 гена, които кодират вирусния протеин.

 

Следващото ни предизвикателство беше да определим еволюционните връзки между тези гени. Колкото по-сходни бяха двата гена, толкова по-вероятно е вирусите с тези гени да са тясно свързани. Тъй като тези последователности са се развили толкова отдавна (вероятно преди първата клетка ), генетичните указателни знаци, показващи къде новите вируси може да са се отделили от общ прародител, са били загубени във времето. Форма на изкуствен интелект, наречена машинно обучение, обаче ни позволи да организираме систематично тези последователности и да откриваме разликите по-обективно, отколкото ако задачата се изпълняваше ръчно.

 

  Тази диаграма показва петте известни по-рано типа на РНК вируси, автоматично организирани по нашите методи. Препечатано с разрешение от Zayed et al., Science Volume 376:156 (2022). Идентифицирахме общо 5504 нови морски РНК вируси и удвоихме броя на известните РНК вирусни фили от пет на 10. Картографирането на тези нови последователности географски разкри, че два от новите типа са особено изобилни в обширни океански региони, с регионални предпочитания в двата умерени и тропически води ( Таравирикота , кръстена на експедицията на Океаните на Тара) или Арктическия океан ( Арктивирикота ).

 

Вярваме, че Taraviricota може да е липсващото звено в еволюцията на РНК вирусите, което изследователите отдавна търсят, свързвайки два различни известни клона на РНК вируси, които се различават в начина, по който се репликират.

 

  Тази карта показва разпространението на РНК вирусите в океана. Размерът на клина е пропорционален на средното изобилие от вируси, присъстващи в тази област, а цветът на клина показва типа на вируса. Препечатано с разрешение от Zayed et al., Science Volume 376:156 (2022). Защо има значение Тези нови последователности помагат на учените да разберат по-добре не само еволюционната история на РНК вирусите, но и еволюцията на ранния живот на Земята.

 

Както показа пандемията от COVID-19, РНК вирусите могат да причинят смъртоносни заболявания. Но РНК вирусите също играят жизненоважна роля в екосистемите , защото могат да заразят широк спектър от организми, включително микроби , които влияят върху околната среда и хранителните мрежи на химическо ниво.

 

Картографирането къде в света живеят тези РНК вируси може да помогне да се изясни как те влияят на организмите, управляващи много от екологичните процеси, които управляват нашата планета. Нашето проучване също така предоставя подобрени инструменти, които могат да помогнат на изследователите да каталогизират нови вируси с нарастването на генетичните бази данни.

 

Вирусите не само причиняват болести. Какво все още не се знае Въпреки идентифицирането на толкова много нови РНК вируси, остава предизвикателство да се определи какви организми заразяват. Понастоящем изследователите също са ограничени предимно до фрагменти от непълни геноми на РНК вируса, отчасти поради тяхната генетична сложност и технологични ограничения.

 

Следващите ни стъпки биха били да разберем какви видове гени може да липсват и как са се променили с течение на времето. Разкриването на тези гени може да помогне на учените да разберат по-добре как работят тези вируси.

 

[ Вземете най-важните заглавия за коронавирус на The Conversation, ежеседмично в научен бюлетин ]

 

МЕДИИ,МИСИРКИ И ИНТЕРНЕТА-

ДАВАМ ОТРИЦАТЕЛЕН ГЛАС, ВОТ ЗА УВОЛНЕНИЕ НА ВСИЧКИ ,АМА ВСИЧКИ ЖУРНАЛИСТИ,МИСИРКИ, РЕПОРТЕРИ...ДА БЪДАТ ИЗПРАТЕНИ В УКРАЙНА
ТЕ СА ПЛАТЕНА "АРМИЯ" НА АМЕРИКА,НАТО И ЕС,ПРОДАЖНА.МЕДИИ СА БЪЛГАРСКИТЕ-ВСИЧКО Е ЛЪЖА ,ТА И ИНТЕРНЕТА ЗАРАЗИХА,"ИЗНАСИЛВАТ" ГО.

ХОРА, ЧУЙТЕ МЕ ПОНЕ ЗА ТОВА! СПРЕТЕ ТВ,

НЕ СЛУШАЙТЕ НОВИНИ И ПРАТЕТЕ ,МИСИРКИТЕ, РЕПОРТЕРИТЕ,

ЖУРНАЛИСТИТЕ,МЕДИИ, ПОЛИТИЦИ ПО ДЯВОЛИТЕ-

ЛЪЖА, ЛЪЖЕ СЕ ПОГОЛОВНО И ВИ ЗОМБИРАТ!

МЕДИИ,МИСИРКИ И ИНТЕРНЕТА- ВСИЧКО Е МАНИПУЛИРАНО,

ЛЪЖИ,ЛЪЖИ И ПАК ЛЪЖИ ПУСКАТ СЕ НЕПРЕСТАННО,

НИЩО ДОСТОВЕРНО!

ГЛЕДАЙТЕ ДРУГИ ТВ .

РАЗБИРА СЕ НЕ НЕ НЕ НЕ ... НА ЕС СТРАНИТЕ И НА НАТО ,АМЕРИКА!

РУСОФОБИТЕ СА ЯКО ПЛАТЕНИ , А НАРОД МИЗЕРУВА!

И НЯМА НАТО,ЗАПОМНЕТЕ ИМА АМЕРИКА ,

ТЯ Е НАТО И СИ ПЕЧАТА ПАРИЧКИТЕ,


ПРАВИ ВОЙНИЧКИТЕ,

НО ТРЕТАТА

ЩЕ Е ПОСЛЕДНА

И ЗА ТЯХ!

... и ще си платят , ЕС И НАТО-не са целият свят. Другите народи, държави ...не са глупави, те виждат амбициите на САЩ ДА ВЛАДЕЕ ЦЯЛ СВЯТ, ДА РАЗПОЛАГА С ВСИЧКИ ДЪРЖАВИ ПО СВЕТА И СЕ ДОСЕЩАТ ,ЧЕ ЩЕ ДОЙДЕ И ТЕХНИЯ РЕД -САЩ ДА ИМ ПОСЕГНЕ АКО Я НЕ СПРАТ ПУСТАТА АМЕРИКА! ТОВА Е САЛУДНИЧАВО ДОРИ И КОСМОСА ЩЕ СЕ ВЪЗПРОТИВИ АМЕРИКА ДА ВЛАДЕЕ СВЕТА-ЗЕМЯТА САМО ГЛЕДАЙТЕ...


А РУСИТЕ И ДОБРИТЕ ХОРА -БЪЛГАРИ ЩЕ ИДАТ В РАЯ.

аман!!!!!!!!!!
10.04 20:35 - rosiela
10.04 19:39 - rosiela
10.04 13:01 - rosiela
10.04 11:00 - blogbg
10.04 10:38 - rosiela
10.04 08:56 - eyanko


Спри се ,злобна ,завистлива жено ,мисирке бойкова!