Въпреки многобройните грешки, автономна информационна система Logistics (АПИО) за F-35 не е така разработен, че правителствените инспекторите установят, че компютърната система не е подходяща за използване. Тези проблеми могат да доведат до забавяне на получаването на нова военна техника в ВВС необходимо да се увеличи неговата борба потенциал. И сега е много неочакван обрат - Богдан казва, че системата АПИО, в края на краищата, не е толкова критична, настоявайки, че F-35 може да лети без него в продължение на 30 дни.

Поддръжниците на проекта F-35 обичат да казват, че новите самолети е "летящ компютър", както ако това само по себе си не оправдава огромните разходи за стотици милиарди долари. Компанията Lockheed Martin отиде малко по-нататък, като го нарече в своите рекламни материали "суперкомпютър".

ALIS е приземен компютърна система, предназначена за диагностика на технически проблеми, нареждане и получаване на резервни части, както и посоката на професионалисти, които да извършват ремонти. Тя се използва и от пилоти за планиране на мисията, и след това да се анализира ефективността му. Най-малко трябва да бъде.

До момента софтуерът е толкова сурова, че специалисти-техници трябваше да намерят времеемки заобикаляне.В един от случаите, те дори трябваше да записват ръчно данните в диска към базата данни, без да се използва за изпращане на масивни количества цивилното над WiFi мрежи файлове.

Експлоатация на самолета е изцяло зависим от компютърните технологии и милиони редове софтуерен код.Следователно фактът, че довършителни ALIS система изостава от графика в продължение на години, непрекъснато се сблъскват с нови предизвикателства, е особено тревожно. В наскоро публикуван доклад на държавната инспекция се посочва, че недостатъците Alis система може да се сложи по един забавен цялата флота.

F-35 Програма Guide отхвърля тези страхове, което ги поставя в една много противоречива позиция. Говорейки в Конгреса през 2014 г., генерал Богдан каза, че "проектът е в момента ALIS система като" система за оръжия "и е важна част от програмата F-35."

В продължение на много години, разработчиците на програмата за F-35 харченето на пари на американския народ в този комплекс логистична система, казват всички, че самолетът няма да лети без него. По данни на Министерството на отбраната, на изразходването ALIS е 16,7 милиарда долара по време на живота на услугата F-35, въпреки че в доклада на инспекторите точност на тази оценка се поставя под въпрос, като отбелязва, че "нарушаването на графика, и функционални проблеми Alis може да доведе до допълнителни разходи в размер на от 20 милиарда до 100 милиарда долара. "